RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR37L1O60883 481 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITPKCQ96DU7 683 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 PXDNQ92626 1479 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCARF1Q14162 830 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 ESPNB1AK53 854 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXO3O43524 673 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 UPP2O95045 317 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF20Q5VTR2 975 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP7BP35670 1465 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRP6O75581 1613 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM47Q96LD4 638 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDK19Q9BWU1 502 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 WASHC4Q2M389 1173 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 WWC1Q8IX03 1113 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITSN1Q15811 1721 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEIOBQ8N635 442 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTECB2RU33 542 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMP1P13497 986 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD21O60216 631 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABL2P42684 1182 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SBNO1A3KN83 1393 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSME1Q06323 249 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRF5Q13568 498 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6ZVU0 165 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ILDR2Q71H61 639 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFP42Q96MM3 310 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALS2Q96Q42 1657 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 EVC2Q86UK5 1308 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX11P35716 441 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB15P59190 212 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 COG6Q9Y2V7 657 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACEP12821 1306 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.5□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCA3Q99758 1704 aa10.5□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMP2P12643 396 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 TESK2Q96S53 571 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGEF10O15013 1369 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP47Q96K76 1375 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAMTS2O95450 1211 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEAQ6S8J7 498 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CABP1Q9NZU7 370 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAC14Q08AM6 782 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 C8orf37Q96NL8 207 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CBLBQ13191 982 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 AFF2P51816 1311 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP6P35125 1406 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms