RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG4-201ENST00000361201 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-201ENST00000361201 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC102AQ96A19 550 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-201ENST00000361201 OTUD5Q96G74 571 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG4-201ENST00000361201 USP48Q86UV5 1035 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 CEP290O15078 2479 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 SHTN1A0MZ66 631 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 SLC10A3P09131 477 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 CXCL9Q07325 125 aa13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.43□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 STARD3NLO95772 234 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 ALDH1B1P30837 517 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 NEUROD1Q13562 356 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.42□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 TBC1D8O95759 1140 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 A1BGP04217 495 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 CRY2Q49AN0 593 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 LAMA3Q16787 3333 aa13.41□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 NPHP1O15259 732 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.4□□□□□ -0.26
CSAG4-201ENST00000361201 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 GPR25O00155 361 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 EGFRP00533 1210 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 NIM1KQ8IY84 436 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.38□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 AOC3Q16853 763 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ZNRF3Q9ULT6 936 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.37□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 VCANP13611 3396 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ADM5C9JUS6 153 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 H0YGN5 161 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 SLC24A1O60721 1099 aa13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 PPIP5K2O43314 1243 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 ABCC12Q96J65 1359 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG4-201ENST00000361201 FAM177BA6PVY3 158 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 YDJCA8MPS7 323 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 RAD17O75943 681 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 TM4SF4P48230 202 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 VPS33BQ9H267 617 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 PRO3102Q9H379 93 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 IL13P35225 146 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF790Q6PG37 636 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 MICALL2Q8IY33 904 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 HLFQ16534 295 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 USP16Q9Y5T5 823 aa13.31□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 FKTNO75072 461 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CSAG4-201ENST00000361201 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms