RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 USP26Q9BXU7 913 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 UTYO14607 1347 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 BCL9O00512 1426 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 RAB11FIP3O75154 756 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 CASP7P55210 303 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 TFCP2Q12800 502 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 BECN1Q14457 450 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 TNS2Q63HR2 1409 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 CHMLP26374 656 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 STARD3NLO95772 234 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 FOXO4P98177 505 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 STAP2Q9UGK3 403 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ATP6V1AP38606 617 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 PALD1Q9ULE6 856 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ITGB4P16144 1822 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC24Q50LG9 513 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ITPK1Q13572 414 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 DTNBO60941 627 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 MRE11P49959 708 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ERBB4Q15303 1308 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 H7C1W4 665 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 ERC2O15083 957 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA1LP34931 641 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 CASC1Q6TDU7 716 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 TIMM10P62072 90 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE4D-204ENST00000358923 TCIRG1Q13488 830 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 HSCBQ8IWL3 235 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 USP21Q9UK80 565 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 SIK1P57059 783 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 FAM227BQ96M60 508 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 UTRNP46939 3433 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 SLIT2O94813 1529 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 PAPPAQ13219 1627 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 COPRSQ9NQ92 184 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.64■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 LRP6O75581 1613 aa21.64■■□□□ 1.06
PDE4D-204ENST00000358923 CPA1P15085 419 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 TNNI3KQ59H18 835 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 REC8O95072 547 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP10Q86W26 655 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE4D-204ENST00000358923 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms