RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 GCKRQ14397 625 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 RBSNQ9H1K0 784 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGBQ92521 554 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC14Q96N46 770 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 MBD3O95983 291 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 RASEFQ8IZ41 740 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WZG4 1122 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 UTYO14607 1347 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 TCHHQ07283 1943 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 SASH1O94885 1247 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 HS1BP3Q53T59 392 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 AACSQ86V21 672 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 AK2P54819 239 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCE3A1L190 88 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 GPATCH3Q96I76 525 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 EP400Q96L91 3159 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 RUFY3Q7L099 469 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA3Q99758 1704 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNB2Q92953 911 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG3Q9NT62 314 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 PTH1RQ03431 593 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNE4Q8N205 404 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 EVI5LQ96CN4 794 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 MRC1P22897 1456 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOC5O00471 708 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 DTNBO60941 627 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 GPTP24298 496 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 USP48Q86UV5 1035 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CHGBP05060 677 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CPA1P15085 419 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 NECTIN1Q15223 517 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS53Q5VIR6 699 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNQ4P56696 695 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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