RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 REC8O95072 547 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 VPS72Q15906 364 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 HLFQ16534 295 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 HSCBQ8IWL3 235 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 SNX21Q969T3 373 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 CNTROBQ8N137 903 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 GPATCH3Q96I76 525 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 KCNQ2O43526 872 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 TFCP2Q12800 502 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1AP38606 617 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 CERKQ8TCT0 537 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 NUP98P52948 1817 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 IL25Q9H293 177 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 GPTP24298 496 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 SIK1P57059 783 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 FAM89AQ96GI7 184 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 USP21Q9UK80 565 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ITPK1Q13572 414 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 TNNI3KQ59H18 835 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 PALLDQ8WX93 1383 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 RABEP1Q15276 862 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 NLRP10Q86W26 655 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 SYNE4Q8N205 404 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 MYT1Q01538 1121 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-201ENST00000331789 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 NFKBIBQ15653 356 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 LRRC24Q50LG9 513 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 EVI5LQ96CN4 794 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 RREB1Q92766 1687 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 SGSM2O43147 1006 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 HSPA1LP34931 641 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 EYA2O00167 538 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 PALD1Q9ULE6 856 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CSF1RP07333 972 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 ATP5JP18859 108 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 MCCP23508 829 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 CIAO1O76071 339 aa21.7■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.7■■□□□ 1.07
ACTB-201ENST00000331789 MYH3P11055 1940 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 FAM182BQ5T319 152 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 KCNQ4P56696 695 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-201ENST00000331789 TIMM10P62072 90 aa21.69■■□□□ 1.06
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