RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.61■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 ACEP12821 1306 aa21.61■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 A0A087WZG4 1122 aa21.61■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 METTL24Q5JXM2 366 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 CNNM3Q8NE01 707 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 HAND2P61296 217 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 HYPKQ9NX55 129 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 WDR62O43379 1518 aa21.6■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 CHMLP26374 656 aa21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 USP16Q9Y5T5 823 aa21.59■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 SNRKQ9NRH2 765 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF213O14771 459 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 PTGS1P23219 599 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 PAFAH1B1P43034 410 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 TYRO3Q06418 890 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.58■■□□□ 1.05
PRKCI-201ENST00000295797 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.58■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.58■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 IGSF3O75054 1194 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 GNG11P61952 73 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 SOGA3Q5TF21 947 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CPA1P15085 419 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 LUZP1Q86V48 1076 aa21.57■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 A0A1W2PP64 1363 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 SYT1P21579 422 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ABCF2Q9UG63 623 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 FOXO3O43524 673 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CTR9Q6PD62 1173 aa21.56■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.55■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 MNAT1P51948 309 aa21.55■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.55■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 NAPBQ9H115 298 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 PLCH2O75038 1416 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 TICAM2Q86XR7 235 aa21.54■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF445P59923 1031 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 INSRP06213 1382 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 YEATS4O95619 227 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.53■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 MSH6P52701 1360 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 DTNBO60941 627 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRKCI-201ENST00000295797 Q6ZUG5 572 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 G2E3Q7L622 706 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 MICU3Q86XE3 530 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 DNAI1Q9UI46 699 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SPECC1Q5M775 1068 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.51■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms