RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226279.7

CD38-201, Transcript of CD38 molecule, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD38, Length 5,668 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38-201ENST00000226279 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.79□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 BICD1Q96G01 975 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 MICU3Q86XE3 530 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 CUL7Q14999 1698 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 USP16Q9Y5T5 823 aa14.78□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 AMPD3Q01432 767 aa14.77□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 SPA17Q15506 151 aa14.77□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 IQCEQ6IPM2 695 aa14.77□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 NCOA7Q8NI08 942 aa14.77□□□□□ -0.04
CD38-201ENST00000226279 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CENPHQ9H3R5 247 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 FBLN1P23142 703 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MBIPQ9NS73 344 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 H0YHG0 523 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TNNI2P48788 182 aa14.77□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 UBA7P41226 1012 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MAP7D2Q96T17 732 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.76□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 USP8P40818 1118 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MAP3K11Q16584 847 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ERMNQ8TAM6 284 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 GCP02774 474 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PLCG2P16885 1265 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CCDC174Q6PII3 467 aa14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 WTAPQ15007 396 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ESR2Q92731 530 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 BAG6P46379 1132 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 A2MP01023 1474 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CNNM3Q8NE01 707 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 KRT23Q9C075 422 aa14.74□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CAMK4Q16566 473 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CNBD1Q8NA66 436 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TTC16Q8NEE8 873 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CTNNA2P26232 953 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MPNDQ8N594 471 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 WDR70Q9NW82 654 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 KCNA6P17658 529 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 DCAF5Q96JK2 942 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 GNAQP50148 359 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CCDC184Q52MB2 194 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ERLIN1O75477 346 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 GRM8O00222 908 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 PRC1O43663 620 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 KSR2Q6VAB6 950 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 NEK1Q96PY6 1258 aa14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 MCM5P33992 734 aa14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ANO10Q9NW15 660 aa14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 STX6O43752 255 aa14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 ALDH1L1O75891 902 aa14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TRIM27P14373 513 aa14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD38-201ENST00000226279 TMTC2Q8N394 836 aa14.71□□□□□ -0.06
CD38-201ENST00000226279 PLCH2O75038 1416 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms