RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 TNK1Q13470 666 aa10.6□□□□□ -0.71
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 LTB4RQ15722 352 aa10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 GTDC1Q4AE62 458 aa10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 SFT2D3Q587I9 215 aa10.58□□□□□ -0.72
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.58□□□□□ -0.72
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