RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SGK494	L7N484	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NDUFS7	O75251	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PLAT	P00750	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CD48	P09326	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CCL3	P10147	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ERG	P11308	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	POU2F1	P14859	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IL1RN	P18510	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FMO4	P31512	558 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC15A1	P46059	708 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NUDT6	P53370	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNJ2	P63252	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ITIH4	Q14624	930 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MLANA	Q16655	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OPN5	Q6U736	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MED29	Q9NX70	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PNV4	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PP18	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	URAD	A6NGE7	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RDH16	O75452	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GPC4	O75487	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C1orf105	O95561	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FTCD	O95954	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ACTL6A	O96019	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C1QA	P02745	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HPN	P05981	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FES	P07332	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CSF3	P09919	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC175	P0C221	793 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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