RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC159P0C7I6 412 aa26.96■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MORN4Q8NDC4 146 aa26.96■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A11Q9NSA0 550 aa26.96■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF721Q8TF20 911 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR14Q9BWN1 585 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8D2Q9GZM6 311 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC16AO15027 2179 aa26.95■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EFNA3P52797 238 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf94Q6P1W5 598 aa26.94■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF773Q6PK81 442 aa26.93■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ENTHD1Q8IYW4 607 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF321PQ8N8H1 164 aa26.92■■□□□ 1.9
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COPS7AQ9UBW8 275 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 LNP1A1A4G5 178 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZAR1LA6NP61 321 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSNK2BP67870 215 aa26.91■■□□□ 1.9
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