RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	DECR1	Q16698	335 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	LGSN	Q5TDP6	509 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	S100PBP	Q96BU1	408 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	CXCL13	O43927	109 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PCDH7	O60245	1069 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ADAM11	O75078	769 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFS7	O75251	213 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	OR4F21	O95013	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PSMG1	O95456	288 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	CD3E	P07766	207 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF17	P17021	662 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	TSPAN8	P19075	237 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	CDKN1A	P38936	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MAGEA12	P43365	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PRR5	P85299	388 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	TRADD	Q15628	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-238	ENST00000568169	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0J9YW62	118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PP18	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UPK1A	O00322	258 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CLOCK	O15516	846 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SLITRK5	O94991	958 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UTS2	O95399	124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SYNGR4	O95473	234 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KRT6A	P02538	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KRT6B	P04259	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TUBB	P07437	444 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SBK3	P0C264	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ADH6	P28332	368 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	AGTR1	P30556	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HSD17B3	P37058	310 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KRT6C	P48668	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RAC1	P63000	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TAB1	Q15750	504 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SPIN4	Q56A73	249 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BBS4	Q96RK4	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NPAS1	Q99742	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79

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