RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 LEFTY2O00292 366 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KIAA0355O15063 1070 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FZD7O75084 574 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LEFTY1O75610 366 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ELFN1P0C7U0 828 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZNF250P15622 560 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 NDUFV2P19404 249 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GABRR2P28476 465 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PRKAR1BP31321 381 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZNF81P51508 661 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CCR8P51685 355 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TAS2R38P59533 333 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FGFBP1Q14512 234 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PXKQ7Z7A4 578 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 MSANTD3Q96H12 275 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 COQ10AQ96MF6 247 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 RBP7Q96R05 134 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 F2RL3Q96RI0 385 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ABHD1Q96SE0 405 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KCNK12Q9HB15 430 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LHX9Q9NQ69 397 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CNIH4Q9P003 139 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GPR34Q9UPC5 381 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 A0A0A6YYD5 115 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TRIM77I1YAP6 450 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZNF749O43361 778 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TMPRSS11DO60235 418 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TMEM127O75204 238 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SERPINI2O75830 405 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SC5DO75845 299 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 MPC2O95563 127 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TGM6O95932 706 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ALDH1A1P00352 501 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 MT-ND5P03915 603 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CXCL3P19876 107 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SHC1P29353 583 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LCN1P31025 176 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SOX9P48436 509 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 INSL4Q14641 139 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GPNMBQ14956 572 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ST3GAL2Q16842 350 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 NIPAL3Q6P499 406 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KRT74Q7RTS7 529 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SIAH3Q8IW03 269 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 OR2L2Q8NH16 312 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 OR5W2Q8NH69 310 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 IL36AQ9UHA7 158 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 GLS2Q9UI32 602 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-202ENST00000542324 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms