RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5M11Q96RB7 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYT11Q9BT88 431 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BIN3Q9NQY0 253 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAK5Q9P286 719 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RCE1Q9Y256 329 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.63□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEP152O94986 1710 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCC5O15440 1437 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1B0GVL5 298 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PR77 199 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9J4A7 227 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 E7EWF7 191 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPIAL4DF5H284 164 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BNH8 94 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 K7EP13 123 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0QYV0 167 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BHLHE40O14503 412 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDIPTO14735 213 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLEU1O43261 78 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLIN3O60664 434 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ENTPD5O75356 428 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TM7SF2O76062 418 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AQP8O94778 261 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TXNDC12O95881 172 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CST1P01037 141 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CA3P07451 260 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACP5P13686 325 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ETS2P15036 469 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ST6GAL1P15907 406 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGAT1P26572 445 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACVR1BP36896 505 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLDN18P56856 261 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAS2R39P59534 338 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SORDQ00796 357 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NHLH2Q02577 135 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGAP1Q07960 439 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB31Q13636 194 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF212Q495C1 297 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHF19Q5T6S3 580 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM225Q6GV28 225 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S100A7AQ86SG5 101 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NRMQ8IXM6 262 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIGXQ8TBF5 258 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APH1BQ8WW43 257 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LPAR1Q92633 364 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HAS1Q92839 578 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM45BQ96B21 275 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTL8Q9H568 366 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 THSD1Q9NS62 852 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CUTCQ9NTM9 273 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 XPR1Q9UBH6 696 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR132Q9UNW8 380 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IRAK3Q9Y616 596 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 U3KQE9 123 aa6.62□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms