RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516252.1

RNU6-415P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 415, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-415P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-415P-201ENST00000516252 TM9SF1O15321 606 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SCRG1O75711 98 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CHRNA1P02708 482 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGHV4-34P06331 123 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 OR8U8P0C7N1 319 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 BTDP43251 543 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 RND3P61587 244 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SYPL1Q16563 259 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 PNCKQ6P2M8 343 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IFNEQ86WN2 208 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 MYDGFQ969H8 173 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 TXN2Q99757 166 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GHRLQ9UBU3 117 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GNSP15586 552 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGLL1P15814 213 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NUDT1P36639 197 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NUMBP49757 651 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPC3P51654 580 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CASP9P55211 416 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPNMBQ14956 572 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 MORF4L2Q15014 288 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 OLFM4Q6UX06 510 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 PHYHIPQ92561 330 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 MBOAT4Q96T53 435 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 FANCFQ9NPI8 374 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 DCDC2Q9UHG0 476 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IFT52Q9Y366 437 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 WDR45Q9Y484 360 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCDC69A6NI79 296 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ANKRD63C9JTQ0 380 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC7A4O43246 635 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GCKP35557 465 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 GALK2Q01415 458 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZP4Q12836 540 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SYVN1Q86TM6 617 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF410Q86VK4 478 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NEK11Q8NG66 645 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NEIL3Q8TAT5 605 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ARNTL2Q8WYA1 636 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SH2D2AQ9NP31 389 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 COMMD8Q9NX08 183 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZMYM6O95789 1325 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 JCHAINP01591 159 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGHV3-48P01763 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 THRBP10828 461 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATP5DP30049 168 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 AXLP30530 894 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 KIR2DS2P43631 304 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC6A8P48029 635 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CSNK1DP48730 415 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ROR1Q01973 937 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF154Q13106 437 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 UBE2V2Q15819 145 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 CARTPTQ16568 116 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC39A12Q504Y0 691 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 LRRC31Q6UY01 552 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 LINC01551Q86U37 167 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ART4Q93070 314 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 EEF2KMTQ96G04 330 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NTN4Q9HB63 628 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NANSQ9NR45 359 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 NECAP2Q9NVZ3 263 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ANKMY1Q9P2S6 941 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF225Q9UK10 706 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms