RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF878	C9JN71	531 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PEX11B	O96011	259 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	S1PR1	P21453	382 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TM4SF4	P48230	202 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPAT4	Q86UL3	456 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HYLS1	Q96M11	299 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR7D2	Q96RA2	312 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	STARD5	Q9NSY2	213 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RASD1	Q9Y272	281 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RAD1	O60671	282 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB2	O95178	105 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN12	O95859	305 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	AK1	P00568	194 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HCK	P08631	526 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	JUND	P17535	347 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PSMB10	P40306	273 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRKCD	Q05655	676 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR5J2	Q8NH18	312 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR5W2	Q8NH69	310 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FGF13	Q92913	245 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP10	Q96AY3	582 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CMKLR1	Q99788	373 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	APOO	Q9BUR5	198 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ABLIM3	O94929	683 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLCO2B1	O94956	709 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CYB5A	P00167	134 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CA3	P07451	260 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ERVFC1	P60507	584 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ACTA2	P62736	377 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ACTG2	P63267	376 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FTMT	Q8N4E7	242 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	BEST4	Q8NFU0	473 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SETD6	Q8TBK2	473 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARRDC3	Q96B67	414 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MBOAT4	Q96T53	435 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF559	Q9BR84	538 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RDH16	O75452	317 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NCR1	O76036	304 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV3-27	P01718	113 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RLN2	P04090	185 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	UCHL1	P09936	223 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	S100G	P29377	79 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TGFBR1	P36897	503 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PITPNB	P48739	271 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TATDN3	Q17R31	274 aa		7.57	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PGGHG	Q32M88	737 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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