RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 TEX37Q96LM6 180 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZBTB18Q99592 522 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PSME2Q9UL46 239 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 A0A1W2PS29 197 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 GABRR3A8MPY1 467 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 C9JVG2 144 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NDUFAB1O14561 156 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC22O60826 627 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SLC35E2P0CK97 266 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 LAMP1P11279 417 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 COX6A1P12074 109 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CPMP14384 443 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 GPX3P22352 226 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OTX2P32243 289 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 XKP51811 444 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PLIN5Q00G26 463 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 BIKQ13323 160 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ATP1A4Q13733 1029 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CEBPEQ15744 281 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 LINC00303Q3SY05 128 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 DCAF10Q5QP82 559 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CPTPQ5TA50 214 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 HPS6Q86YV9 775 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 TESCQ96BS2 214 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 COQ8BQ96D53 544 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF681Q96N22 645 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 DGAT2Q96PD7 388 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CLMPQ9H6B4 373 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SAR1AQ9NR31 198 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MRGBPQ9NV56 204 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PCSK5Q92824 1860 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FAM234BA2RU67 622 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FCHO1O14526 889 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR10H2O60403 315 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 HPP00738 406 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IFNA16P05015 189 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ATP1B1P05026 303 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IL6P05231 212 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PRKAR1AP10644 381 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SFTPCP11686 197 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 TNNI3P19429 210 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IL12AP29459 219 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NTSP30990 170 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 S100A3P33764 101 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MPIP34949 423 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 DGKQP52824 942 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 POLE2P56282 527 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 WNT3P56703 355 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR4D2P58180 307 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 AP2B1P63010 937 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms