RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ANGPTL1O95841 491 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 CD1EP15812 388 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 GPC1P35052 558 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 ETV4P43268 484 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXB3-211ENST00000490677 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-211ENST00000490677 CEP70Q8NHQ1 597 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-211ENST00000490677 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-211ENST00000490677 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-211ENST00000490677 ALG1L2C9J202 215 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 FBXO30Q8TB52 745 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 FIG4Q92562 907 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 AGR3Q8TD06 166 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 FIGNL1Q6PIW4 674 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 MEIOBQ8N635 442 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXB3-211ENST00000490677 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PPP3R2Q96LZ3 170 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 DACH2Q96NX9 599 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PIGQQ9BRB3 760 aa25.04■■□□□ 1.6
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