RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SZRD1	Q7Z422	152 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MIER2	Q8N344	545 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	STON2	Q8WXE9	905 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MOAP1	Q96BY2	351 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		15.73	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PBE3	544 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UPK1A	O00322	258 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GNB5	O14775	395 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN1	P31025	176 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAG1	P54619	331 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NME5	P56597	212 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY1A3	Q02108	690 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DECR1	Q16698	335 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	AAGAB	Q6PD74	315 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP43	Q8NFH3	380 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52B2	Q96RD2	323 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ADO	Q96SZ5	270 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UCK2	Q9BZX2	261 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9N2J8	555 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NPHS2	Q9NP85	383 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGBP	Q9NV56	204 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD2	O15018	2839 aa		15.72	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	IL6	P05231	212 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT16	P08779	473 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PCYT1A	P49585	367 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRIM2	P49643	509 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS1	P54826	345 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GFRA1	P56159	465 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO7	P57737	925 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UFM1	P61960	85 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TLE4	Q04727	773 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RCAN2	Q14206	197 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NNAT	Q16517	81 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MAVS	Q7Z434	540 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CBLC	Q9ULV8	474 aa		15.71	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		15.71	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JND7	137 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FADS1	O60427	444 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GOSR1	O95249	250 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	IL33	O95760	270 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OPRM1	P35372	400 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K8	P41279	467 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCL1	P50553	236 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53BP2	Q13625	1128 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EIPR1	Q53HC9	387 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E6	Q96RD3	313 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TM9SF2	Q99805	663 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RMND5A	Q9H871	391 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GIN1	Q9NXP7	522 aa		15.7	■□□□□ 0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms