RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	THEG	Q9P2T0	379 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB23	Q9ULC3	237 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf42	Q9H799	3197 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PS29	197 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TLCD2	A6NGC4	264 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GLOD5	A6NK44	160 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC36	A6NLP5	189 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BMH7	237 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAAH	O00519	579 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	AQP9	O43315	295 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	AHCYL1	O43865	530 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC28A2	O43868	658 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BP5	O60239	455 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PIAS2	O75928	621 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC14L2	O76054	403 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DIRAS1	O95057	198 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CLIC3	O95833	236 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	EPPIN	O95925	133 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	AK1	P00568	194 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN1SW	P03999	348 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PROS1	P07225	676 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HTR1A	P08908	422 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35E2	P0CK97	266 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NR2F1	P10589	423 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TDGF1	P13385	188 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PVR	P15151	417 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAH	P16930	419 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRB1	P18505	474 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ITIH1	P19827	911 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DCK	P27707	260 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GGT2	P36268	569 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR3	P46089	330 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL12	P48061	93 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	XK	P51811	444 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SCAND1	P57086	179 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ESRRG	P62508	458 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35A2	P78381	396 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BIK	Q13323	160 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf61	Q13536	156 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RAPSN	Q13702	412 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SYPL1	Q16563	259 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA9	Q16795	377 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB134	Q4QY38	66 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTE1	Q5JU00	501 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	XAF1	Q6GPH4	301 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM107	Q6UX40	140 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7G2	Q8NG99	324 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PROX1	Q92786	737 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB8B	Q92930	207 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35B4	Q969S0	331 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGED4	Q96JG8	741 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRC1	Q96M27	445 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	COL21A1	Q96P44	957 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7D2	Q96RA2	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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