RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MIEF1Q9NQG6 463 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 M0R3H8 397 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CATP04040 527 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRLHRP49683 370 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MAZP56270 477 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MPEG1Q2M385 716 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR56A3Q8NH54 315 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TMEM19Q96HH6 336 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR2AG1Q9H205 316 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CD93Q9NPY3 652 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KCND3Q9UK17 655 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FBXL2Q9UKC9 423 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF175Q9Y473 711 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SPINT1O43278 529 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 UGDHO60701 494 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HPXP02790 462 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CLTBP09497 229 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 F8A1P23610 371 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PPM1AP35813 382 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARHGDIBP52566 201 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CDH11P55287 796 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF763Q0D2J5 394 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF805Q5CZA5 627 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GPR32P1Q8NGA4 272 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IL17FQ96PD4 163 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TBX5Q99593 518 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NDOR1Q9UHB4 597 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 COPS3Q9UNS2 423 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KRBOX1C9JBD0 128 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PDCD5O14737 125 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MID1O15344 667 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SIGLEC5O15389 551 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GPR37L1O60883 481 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KLHL18O94889 574 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NPPBP16860 134 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C4BPBP20851 252 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SHC1P29353 583 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CBX5P45973 191 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR10A3P58181 314 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TAP2Q03519 686 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF77Q15935 545 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GSG1Q2KHT4 349 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 COMMD6Q7Z4G1 85 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NR2C2APQ86WQ0 139 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD53Q8N9V6 530 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TEX47Q8TBZ9 253 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ASB12Q8WXK4 309 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HGDQ93099 445 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CHFRQ96EP1 664 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF197O14709 1029 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C1orf105O95561 183 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TFP02787 698 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KLK1P06870 262 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PEPDP12955 493 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DEFA5Q01523 94 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SFRP5Q5T4F7 317 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IL17RCQ8NAC3 791 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GPA33Q99795 319 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A15Q9H2J7 730 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IL20RAQ9UHF4 553 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KIF25Q9UIL4 384 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 STON1Q9Y6Q2 735 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 NDUFA2O43678 99 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FAM198BQ6UWH4 519 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DPPA4Q7L190 304 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OLIG3Q7RTU3 272 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms