RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SDF2	Q99470	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RELN	P78509	3460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525		E9PLN8	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FXYD1	O00168	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MASP2	O00187	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CLIC1	O00299	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SCD	O00767	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DNPH1	O43598	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC28A2	O43868	658 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FMO6P	O60774	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ICOSLG	O75144	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	REM1	O75628	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PDE9A	O76083	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	WISP1	O95388	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANP32D	O95626	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NTN1	O95631	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	IGF2	P01344	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CRH	P06850	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ARAF	P10398	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CYP4B1	P13584	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NID1	P14543	1247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DRD4	P21917	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MATN1	P21941	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GABRA3	P34903	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PEX19	P40855	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CA7	P43166	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HTR3A	P46098	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC6A8	P48029	635 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CASP6	P55212	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GFRA1	P56159	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FBXW4	P57775	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HPCA	P84074	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	KLF10	Q13118	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RAPSN	Q13702	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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