RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PLOD2	O00469	737 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	TSPAN2	O60636	221 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PEX11A	O75192	247 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC22B	O75396	215 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SLITRK5	O94991	958 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CRH	P06850	196 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CT45A8	P0DMV1	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CT45A9	P0DMV2	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF708	P17019	499 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	DPP4	P27487	766 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	LHX2	P50458	406 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	AQP5	P55064	265 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	KAT2A	Q92830	837 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MPDZ	O75970	2070 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028		A8MXE2	369 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MSTN	O14793	375 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PLOD3	O60568	738 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	TGDS	O95455	350 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	HRG	P04196	525 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PEPD	P12955	493 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CPOX	P36551	454 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	STAR	P49675	285 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC24C	P53992	1094 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CLDN18	P56856	261 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CORO7	P57737	925 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028		Q6ZSR9	355 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FCRL1	Q96LA6	429 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf109	Q9NX04	203 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A0G2JND7	137 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PNV4	684 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	HCRTR2	O43614	444 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PRPH2	P23942	346 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	EVI2B	P34910	448 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PCYT1A	P49585	367 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.96	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms