RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNTL6	Q49A17	601 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	XKR7	Q5GH72	579 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR93	Q6P2C0	686 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	EMB	Q6PCB8	327 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	APOOL	Q6UXV4	268 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF18B	Q86Y91	864 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3R3	Q92569	461 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CAVIN3	Q969G5	261 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MED11	Q9P086	117 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TYROBP	O43914	113 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNH1	O95259	989 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	UTS2	O95399	124 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TGM6	O95932	706 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	INHBB	P09529	407 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PEPD	P12955	493 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	HK1	P19367	917 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ETV4	P43268	484 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MLC1	Q15049	377 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH3	Q86UD3	253 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP43	Q8NFH3	380 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM110B	Q8TC76	370 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EQTN	Q9NQ60	294 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ARID1A	O14497	2285 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01387	J3KSC0	135 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF13	O75888	250 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGPTL1	O95841	491 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NGFR	P08138	427 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ACP2	P11117	423 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	STX5	Q13190	355 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR151	Q8TDV0	419 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf30	Q96M34	536 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		16	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2M5	A3KFT3	312 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM114	B3SHH9	223 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG1L2	C9J202	215 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC8	O43402	210 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	BPGM	P07738	259 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RFX3	P48380	749 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKAG1	P54619	331 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RAET1L	Q5VY80	246 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MREG	Q8N565	214 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGM	Q9H3S5	423 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		15.98	■□□□□ 0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms