RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 RAB41Q5JT25 222 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.68□□□□□ -0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 OR6C6A6NF89 314 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 LAMTOR5O43504 91 aa13.68□□□□□ -0.22
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PTPRU-204ENST00000428026 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA0355O15063 1070 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 DIRAS3O95661 229 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 RPS17P08708 135 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 CHRNB1P11230 501 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 AKR1C2P52895 323 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1W2PP55 124 aa13.67□□□□□ -0.22
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