RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-204ENST00000403441 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.13□□□□□ -0.63
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PRAME-204ENST00000403441 KAT2AQ92830 837 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 VSTM2LQ96N03 204 aa11.13□□□□□ -0.63
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