RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF154Q13106 437 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 AANATQ16613 207 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGKQ53H12 422 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF691Q5VV52 312 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LEG1Q6P5S2 330 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLEU7Q6UYE1 221 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNM1P46Q6ZS02 220 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC36Q8IYA8 594 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 BPIFB2Q8N4F0 458 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2AP1Q8NGE2 309 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2A12Q8NGT7 310 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARNTL2Q8WYA1 636 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX21Q969T3 373 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35E1Q96K37 410 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRTNQ99748 197 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 COQ7Q99807 217 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NARFLQ9H6Q4 476 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 APMAPQ9HDC9 416 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDAP2Q9NXN4 497 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRR3Q9UBC9 169 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCMT1Q9UIC8 334 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRK1Q38SD2 2015 aa1.84□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 METP08581 1390 aa1.84□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0U1RRA0 63 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASKO14936 926 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM9SF1O15321 606 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXCL14O95715 111 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTR1FP30939 366 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS10P46783 165 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC6A8P48029 635 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP107P57740 925 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRP54P61011 504 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf67Q0P5P2 114 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 HFEQ30201 348 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP221Q4G0U5 840 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT77Q7Z794 578 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFNEQ86WN2 208 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCA1Q86XH1 822 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR9A1PQ8NGU1 263 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 EEF2KMTQ96G04 330 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM101Q96IK0 257 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELMO2Q96JJ3 720 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBX15Q96SF7 602 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf40Q9H1Z8 148 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCAP29Q9UHQ4 241 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFT52Q9Y366 437 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 WSB1Q9Y6I7 421 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARID1AO14497 2285 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NACAE9PAV3 2078 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7ENP7 123 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF264O43296 627 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNAI2O43623 268 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOSR1O95249 250 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV2D-28P01615 120 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLL1P15814 213 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN8P19075 237 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTR1EP28566 365 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPDP32754 393 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 GCKP35557 465 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTR5AP47898 357 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 STARP49675 285 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUMBP49757 651 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 VLDLRP98155 873 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYBPC1Q00872 1141 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRIT3Q3SXY7 679 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC39A4Q6P5W5 647 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF562Q6V9R5 426 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q7L0L9 218 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM252Q8N6L7 170 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM185AQ8NFB2 350 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEK11Q8NG66 645 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCH1Q8TCQ1 289 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 C7orf33Q8WU49 177 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 RDH5Q92781 318 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA13Q96N96 652 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NFKBIZQ9BYH8 718 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAB39LQ9H9S4 337 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASTN1O14525 1302 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms