RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CD300LBA8K4G0 201 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GAAP10253 952 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CHRNB1P11230 501 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TAP2Q03519 686 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 MICAQ29983 383 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 DCST2Q5T1A1 773 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 NAGSQ8N159 534 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TXNDC15Q96J42 360 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR5B2Q96R09 309 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 C2orf72A6NCS6 295 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 APLNRP35414 380 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 MGAT3Q09327 533 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 LCN8Q6JVE9 175 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 BOCQ9BWV1 1114 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CSF2RAP15509 400 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 BPIP17213 487 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 MELKQ14680 651 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CST6Q15828 149 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SFXN5Q8TD22 340 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.19■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 DVL2O14641 736 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 STC2O76061 302 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CDK1P06493 297 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SYPP08247 313 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRSS56P0CW18 603 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 RAB3AP20336 220 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 HTR6P50406 440 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPR50Q13585 617 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 RGNQ15493 299 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GTDC1Q4AE62 458 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRR22Q8IZ63 422 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CACNG2Q9Y698 323 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 LAMTOR5O43504 91 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GCH1P30793 250 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 WNT4P56705 351 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRPS1P60891 318 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 COQ5Q5HYK3 327 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF767PQ75MW2 155 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GABRR1P24046 479 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SNAPC3Q92966 411 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 NT5C3BQ969T7 300 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLN5O75503 358 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SSTR4P31391 388 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 LPAL2Q16609 132 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ITFG2Q969R8 447 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CD300AQ9UGN4 299 aa15.18■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 LIPCP11150 499 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R31P59538 309 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLAMF9Q96A28 289 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF778Q96MU6 729 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPATCH2Q9NW75 528 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 EFCAB7A8K855 629 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CRABP1P29762 137 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 CA5AP35218 305 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 SPINT3P49223 89 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 AGAP6Q5VW22 663 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 AGAP4Q96P64 663 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 THSD1Q9NS62 852 aa15.17■□□□□ 0.02
RXRA-201ENST00000356384 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms