RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FUT1P19526 365 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 S100PP25815 95 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DCST2Q5T1A1 773 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TOMM40LQ969M1 308 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TIMP2P16035 220 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CDRT4Q8N9R6 151 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ALG8Q9BVK2 526 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SULT2B1O00204 365 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PRPS1P60891 318 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TMIEQ8NEW7 156 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CD53P19397 219 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LCN8Q6JVE9 175 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ACOT4Q8N9L9 421 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MSL3P1P0C860 447 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DAP3P51398 398 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TAP2Q03519 686 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 AADACL4Q5VUY2 407 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 OR5W2Q8NH69 310 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CHPT1Q8WUD6 406 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB10P40306 273 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RNF175Q8N4F7 328 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MEIS3P1A6NDR6 274 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MSANTD3Q96H12 275 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GJA5P36382 358 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOWP63302 87 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LILRB2Q8N423 598 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PINK1Q9BXM7 581 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 IL7P13232 177 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CTSCP53634 463 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GABARAPL2P60520 117 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-25P63136 954 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 KDELC1Q6UW63 502 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PXKQ7Z7A4 578 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DTD2Q96FN9 168 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 IL17CQ9P0M4 197 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CACNA1FO60840 1977 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MPIG6BO95866 241 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 DRD5P21918 477 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CXCL12P48061 93 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PRKYO43930 277 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 PCGF3Q3KNV8 242 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 MARVELD2Q8N4S9 558 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CAMK2AQ9UQM7 478 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM239Q8WW34 195 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GDE1Q9NZC3 331 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LRRTM2O43300 516 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 IFNA1P01562 189 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 GABRR1P24046 479 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 BMXP51813 675 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 LHPPQ9H008 270 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SHOXO15266 292 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ETV5P41161 510 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CCNJQ5T5M9 372 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf135Q5VTT2 229 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 ANTXRLA6NF34 631 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CAPNS1P04632 268 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HSD17B1P14061 328 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CRABP1P29762 137 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A8P48029 635 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CAMLGP49069 296 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 HLCSP50747 726 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 CYS1Q717R9 158 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRM-201ENST00000332175 C7P10643 843 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB11Q9UBS4 358 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA5P05154 406 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms