RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308394.8

CASP3-201, Transcript of caspase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP3, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3-201ENST00000308394 SNTA1Q13424 505 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 VEZF1Q14119 521 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZMYND11Q15326 602 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ENPP6Q6UWR7 440 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TMEM64Q6YI46 380 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 GPR141Q7Z602 305 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF595Q8IYB9 648 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR56A1Q8NGH5 318 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR5D16Q8NGK9 328 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 XAGE5Q8WWM1 108 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 MOAP1Q96BY2 351 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 MVB12AQ96EY5 273 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 UGT2B28Q9BY64 529 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TMEM9BQ9NQ34 198 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RARRES3Q9UL19 164 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ERGIC3Q9Y282 383 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FMO6PO60774 539 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PRKD3O94806 890 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SLITRK5O94991 958 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 MT-ND1P03886 318 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR12D1P0DN82 309 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CD59P13987 128 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PPP2R1BP30154 601 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 KDELR2P33947 212 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CDK6Q00534 326 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FOXO1Q12778 655 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TRIP10Q15642 601 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 Q6ZNX1 250 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ADCK1Q86TW2 530 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SLITRK4Q8IW52 837 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LILRA2Q8N149 483 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR7G2Q8NG99 324 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SFXN5Q8TD22 340 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR51I1Q9H343 314 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TMEM38AQ9H6F2 299 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LRRC42Q9Y546 428 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 A0A1B0GX78 115 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 C5orf58C9J3I9 102 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 UPK1AO00322 258 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 HMGN4O00479 90 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 DSCR3O14972 297 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CTNSO60931 367 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ATP1B1P05026 303 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 BCHEP06276 602 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 GP1BAP07359 652 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 MAOAP21397 527 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PCGF2P35227 344 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CHRNB3Q05901 458 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RBBP4Q09028 425 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 KCTD21Q4G0X4 260 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LPCAT4Q643R3 524 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FAM111BQ6SJ93 734 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF227Q86WZ6 799 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NAXDQ8IW45 347 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 C16orf58Q96GQ5 468 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OCIAD1Q9NX40 245 aa10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 BLACEA4D250 179 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 EFCAB7A8K855 629 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CLOCKO15516 846 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SCRG1O75711 98 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 VHLP40337 213 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ATP12AP54707 1039 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TCF15Q12870 199 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FDX2Q6P4F2 183 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TPD52L3Q96J77 140 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CHID1Q9BWS9 393 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NCDNQ9UBB6 729 aa9.99□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 AASSQ9UDR5 926 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms