RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 CT62P0C5K7 136 aa22.3■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa22.28■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 APOL3O95236 402 aa22.28■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.27■■□□□ 1.16
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TRIM54-201ENST00000296098 CDHR4A6H8M9 788 aa22.26■■□□□ 1.15
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TRIM54-201ENST00000296098 PMM1Q92871 262 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRIM54-201ENST00000296098 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TRIM54-201ENST00000296098 A0A075B6Q4 140 aa22.25■■□□□ 1.15
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