RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ERGP11308 486 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CD247P20963 164 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ADH6P28332 368 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AQP1P29972 269 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNGR2P38484 337 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP2K4P45985 399 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 XCR1P46094 333 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KHKP50053 298 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BCAP31P51572 246 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CRISP1P54107 249 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B15P54855 530 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 COPZ1P61923 177 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ABATP80404 500 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MC2RQ01718 297 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 COX10Q12887 443 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT33BQ14525 404 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MLC1Q15049 377 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 INAQ16352 499 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGD6Q17RP2 521 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF385BQ569K4 471 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DCST1Q5T197 706 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SAXO2Q658L1 398 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP12Q6UXS9 341 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AHSA2Q719I0 299 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A8Q8N695 610 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS10Q8TAM1 723 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SFXN5Q8TD22 340 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MAL2Q969L2 176 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TAMM41Q96BW9 452 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LGALS12Q96DT0 336 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNC2Q96PR1 638 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS4Q96RK4 519 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX12Q9BXU0 123 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A8Q9BY19 250 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 UCK2Q9BZX2 261 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF1Q9NS23 344 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EHD3Q9NZN3 535 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CALML5Q9NZT1 146 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL3Q9UH77 587 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS38A1L453 326 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ARGFXA6NJG6 315 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS44E7EML9 344 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFS4O43181 175 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MED26O95402 600 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SOD1P00441 154 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTM3P21266 225 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CBLP22681 906 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACVR2AP27037 513 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OPRL1P41146 370 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MASP1P48740 699 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL11P51671 97 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP5CP53041 499 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MVDP53602 400 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFA1P59665 94 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFA3P59666 94 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 VBP1P61758 197 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF45Q02386 682 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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