RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 SRFP11831 508 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 RBMXP38159 391 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 BMXP51813 675 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 DNAAF1Q8NEP3 725 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 OR9A4Q8NGU2 314 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ZNF480Q8WV37 535 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 FGF21Q9NSA1 209 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 VNN3Q9NY84 501 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 ALS2Q96Q42 1657 aa13.02□□□□□ -0.32
USP22-201ENST00000261497 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 RBBP9O75884 186 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HRGP04196 525 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 S100PP25815 95 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 TPMTP51580 245 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 TGFBR3Q03167 851 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 FGFBP1Q14512 234 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CPNE5Q9HCH3 593 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PTTG1O95997 202 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 GTF2F2P13984 249 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HERV-K104P61576 105 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 MLC1Q15049 377 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SLC14A2Q15849 920 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 OR52N2Q8NGI0 321 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ARL5BQ96KC2 179 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ADOQ96SZ5 270 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PADI1Q9ULC6 663 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SLX4Q8IY92 1834 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PSMB5P28074 263 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CDKN2CP42773 168 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 NTRK2Q16620 822 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 OR6C1Q96RD1 312 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 FOXQ1Q9C009 403 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 KCND3Q9UK17 655 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.02□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 GLI3P10071 1580 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PCDH17O14917 1159 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 UGT2B10P36537 528 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HSD11B2P80365 405 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 DTX3Q8N9I9 347 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 NLKQ9UBE8 527 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SULT2B1O00204 365 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 NDUFV2P19404 249 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 OR13H1Q8NG92 308 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 MKS1Q9NXB0 559 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 C1orf105O95561 183 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HPRP00739 348 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 GPR4P46093 362 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 POU3F4P49335 361 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 C22orf42Q6IC83 251 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PTERQ96BW5 349 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 L3HYPDHQ96EM0 354 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 HDAC8Q9BY41 377 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SMOXQ9NWM0 555 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 H0YGG7 62 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SFTPBP07988 381 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SLC6A8P48029 635 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CEACAM7Q14002 265 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 OR2T4Q8NH00 348 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 MYADMQ96S97 322 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CCDC32Q9BV29 185 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 FN3KQ9H479 309 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PRSS21Q9Y6M0 314 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 SPTA1P02549 2419 aa13.01□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CDC14CA4D256 554 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 BPNT1O95861 308 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 RHCEP18577 417 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CTXN1P60606 82 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 CDK10Q15131 360 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 PKDCCQ504Y2 493 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 TEX26Q8N6G2 289 aa13□□□□□ -0.33
USP22-201ENST00000261497 BIN3Q9NQY0 253 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms