RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RFXANKO14593 260 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR12D1P0DN82 309 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ABOP16442 354 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 CAPN3P20807 821 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TRPC1P48995 793 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 STX1BP61266 288 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FUT5Q11128 374 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SQLEQ14534 574 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 GTDC1Q4AE62 458 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FJX1Q86VR8 437 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZFP90Q8TF47 636 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUH1 482 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR14I1A6ND48 311 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DUXAA6NLW8 204 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ZIC3O60481 467 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC6AO75865 159 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 AGFG2O95081 481 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL1O95841 491 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 GXYLT1Q4G148 440 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 AGKQ53H12 422 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 COX20Q5RI15 118 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 RNF130Q86XS8 419 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR2M3Q8NG83 312 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 RAB8BQ92930 207 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 LDAHQ9H6V9 325 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 MED11Q9P086 117 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.27■□□□□ 0.84
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 HMGN4O00479 90 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 FCMRO60667 390 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NPIPA8P0DM63 369 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 KLHL26Q53HC5 615 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CD163Q86VB7 1156 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SPDL1Q96EA4 605 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ITCHQ96J02 903 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DSN1Q9H410 356 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RMND5AQ9H871 391 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A5Q9Y345 797 aa20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CCL21O00585 134 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PRRG2O14669 202 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TPOP07202 933 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 STX5Q13190 355 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C3P1Q6ZMU1 363 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MEMO1Q9Y316 297 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.26■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQD3 144 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GUSBP08236 651 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SRD5A2P31213 254 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ARFIP2P53365 341 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ATP12AP54707 1039 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MAPK11Q15759 364 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CD226Q15762 336 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 VASNQ6EMK4 673 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms