RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfand1Q8BFR6 268 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akr1c21Q91WR5 323 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhac1Q91Y10 964 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sec13Q9D1M0 322 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm29797A0A140LIA7 188 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm13124A2A752 406 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SvaE9PX96 165 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp97E9PZP6 546 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp960L7N267 546 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nmur1O55040 428 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ClppO88696 272 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bglap3P54615 95 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CpeQ00493 476 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcl2a1bQ497M6 172 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xrcc1Q60596 631 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timd4Q6U7R4 343 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r110Q7M712 333 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otub1Q7TQI3 271 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mgat4bQ812F8 548 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mal2Q8BI08 175 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap5m1Q8BJ63 490 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc73Q8JZM7 531 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nfatc4Q8K120 901 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lyrm4Q8K215 91 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cables2Q8K3M5 476 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ahsa2Q8N9S3 331 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FevQ8QZW2 237 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fahd1Q8R0F8 227 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lipt1Q8VCM4 373 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc3a1Q91WV7 685 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nrip3Q9JJR9 240 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr601A2RS33 314 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r98E9PZ56 857 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prss56F2YMG0 604 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NgpO08692 167 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EomesO54839 707 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dok2O70469 412 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mid1O70583 680 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CtslP06797 334 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TtlP38585 377 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sox3P53784 375 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trp53i11Q4QQM4 189 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taar7bQ5QD11 358 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fzd3Q61086 666 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfsd6Q8CBH5 775 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r83Q8R287 306 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Blzf1Q8R2X8 403 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr791Q8VGJ0 312 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhb16Q91Y03 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ube2fQ9CY34 185 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akr1e2Q9DCT1 301 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr88Q9EPB7 384 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ate1Q9Z2A5 516 aa16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3952A0A0A6YXJ1 191 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cela3aA2A9U8 283 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21904A8HG57 180 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl3E0CZ16 587 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp599E9PWP1 548 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21866J3QMH4 180 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sp3O70494 783 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klrg1O88713 188 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il2raP01590 268 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Syt4P40749 425 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd38P56528 304 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpina3mQ03734 418 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sox9Q04887 507 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tigd2Q0VBL1 525 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 C130050O18RikQ497Y9 356 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RflnbQ5SVD0 216 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trmt12Q8BG71 446 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiss1rQ91V45 396 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q91V76 315 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcbld2Q91ZV3 769 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exo5Q9CXP9 373 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc46a3Q9DC26 460 aa16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4a32A2A8T1 509 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B3galt2O54905 422 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sod2P09671 222 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wnt4P22724 351 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GalP47212 124 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alox5P48999 674 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp2cbP62715 309 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp2caP63330 309 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prelid2Q0VBB0 177 aa16.96■□□□□ 0.31
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.2 ms