RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RASAL1O95294 804 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB40ALP0C0E4 278 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IL7RP16871 459 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 RHCEP18577 417 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1C1P21283 382 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 DCTP40126 519 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NRF1Q16656 503 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 FLYWCH1Q4VC44 716 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 TBPL2Q6SJ96 375 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf44Q96CB5 159 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGDIGQ99819 225 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 WWTR1Q9GZV5 400 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 U3KQV3 271 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA7E9PJI5 369 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 J3KTA2 159 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX12O00623 359 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF15O95150 251 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA8P0DM63 369 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 YAP1P46937 504 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RFX3P48380 749 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF836Q6ZNA1 936 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF605Q86T29 641 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 AMER2Q8N7J2 671 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf47Q8NEP4 570 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GAL3ST4Q96RP7 486 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 REEP1Q9H902 201 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R3H8 397 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH17O14917 1159 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMDEC1O15204 470 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA7AO75326 666 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 E2F6O75461 281 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NID1P14543 1247 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TCN2P20062 427 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RRM2P31350 389 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FOLR3P41439 243 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN52Q52LA3 116 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TCTN3Q6NUS6 607 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLIP4Q8N3C7 705 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CT55Q8WUE5 264 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 VMP1Q96GC9 406 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PIP5K1AQ99755 562 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 EI24O14681 340 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TO15178 435 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FPR1P21462 350 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A5P58743 744 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF4P78317 190 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NHLH1Q02575 133 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DECR1Q16698 335 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 STK32CQ86UX6 486 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ESX1Q8N693 406 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF597Q96LX8 424 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LMF1Q96S06 567 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 EPYCQ99645 322 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL28Q9NXS3 571 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SDK2Q58EX2 2172 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN24A6NM45 220 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 IL33O95760 270 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHEP01854 428 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PCOLCEQ15113 449 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF141Q15928 474 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 EIPR1Q53HC9 387 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF220Q5VTB9 566 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HSDL2Q6YN16 418 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST5Q8IZT8 346 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NRBF2Q96F24 287 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RLIMQ9NVW2 624 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 KCND3Q9UK17 655 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf72A4D263 438 aa22.98■■□□□ 1.27
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