RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602837.1

UBE2E3-211, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 814 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-211ENST00000602837 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 ABI3Q9P2A4 366 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2E3-211ENST00000602837 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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UBE2E3-211ENST00000602837 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 FCHO1O14526 889 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 DYNC1I1O14576 645 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 HPCAL1P37235 193 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 CASRP41180 1078 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MAP2K6P52564 334 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 PTGR1Q14914 329 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MAVSQ7Z434 540 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF843Q8N446 348 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SYT8Q8NBV8 401 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 CFHR4Q92496 578 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 FBXL20Q96IG2 436 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.64□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MED4Q9NPJ6 270 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 ZZEF1O43149 2961 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MGAQ8IWI9 3026 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 H3BML4 177 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 C1QL1O75973 258 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 OR2J2O76002 312 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 CLPSP04118 112 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 IGKV3-11P04433 115 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 S1PR1P21453 382 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SSR4P51571 173 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SLC37A1P57057 533 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 HSPB3Q12988 150 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 TUBA3CQ13748 450 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 SMU1Q2TAY7 513 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2E3-211ENST00000602837 SPINK14Q6IE38 97 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 TMEM107Q6UX40 140 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 TMEM64Q6YI46 380 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 HPS6Q86YV9 775 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2E3-211ENST00000602837 TMEM156Q8N614 296 aa6.63□□□□□ -1.35
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