RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NTMQ9P121 344 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf74A8MZ97 194 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf51C9J302 202 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 BTN3A3O00478 584 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC30A4O14863 429 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCR3O14972 297 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PGRMC2O15173 223 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX1O43435 398 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFSF14O43557 240 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKYO43930 277 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA7AO75326 666 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DLGAP3O95886 979 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 STATHP02808 62 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT2B7P16662 529 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ALOX12P18054 663 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 GIPRP48546 466 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MAN2A2P49641 1150 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMK1P53667 647 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 WNT4P56705 351 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2CBP62714 309 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SKP1P63208 163 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2CAP67775 309 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX1Q16384 188 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EOGTQ5NDL2 527 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MANEAQ5SRI9 462 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C18orf63Q68DL7 685 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OOSP2Q86WS3 158 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2L13Q8N349 312 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 POC5Q8NA72 575 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DIO2Q92813 273 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF14Q92915 247 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RNFT2Q96EX2 444 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF681Q96N22 645 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPNQ9BXN1 380 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HHATLQ9HCP6 504 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 POLE3Q9NRF9 147 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 POT1Q9NUX5 634 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SATB2Q9UPW6 733 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR45Q9Y484 360 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WV62 115 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5K4A6NMS3 321 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PPM1DO15297 605 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TPST2O60704 377 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FMO6PO60774 539 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 COQ9O75208 318 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 GPX5O75715 221 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RASGRP1O95267 797 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 IL1AP01583 271 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ALPPL2P10696 532 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CPMP14384 443 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CPEP16870 476 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms