RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4N2Q8NGD1 307 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5L2Q8NGL0 311 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf44Q96CB5 159 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 GAL3ST4Q96RP7 486 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC7Q9H6L4 198 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL28Q9NXS3 571 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KCND3Q9UK17 655 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 TERTO14746 1132 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCCQ4KMZ1 466 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 LIN52Q52LA3 116 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NRSN2Q9GZP1 204 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf4Q9NR00 106 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC13A4Q9UKG4 626 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DXOO77932 396 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IL33O95760 270 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 COX6A1P12074 109 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T5Q6IEZ7 315 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T29Q8NH02 315 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZG16BQ96DA0 208 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD1Q9GZZ0 328 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO34Q9NWN3 711 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 GNGT2O14610 69 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NID1P14543 1247 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DLSTP36957 453 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFAF7Q7L592 441 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 M1APQ8TC57 530 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 EME1Q96AY2 570 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IMMP1LQ96LU5 166 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL4Q9C0H6 718 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFAF4Q9P032 175 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ENPP4Q9Y6X5 453 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_2039718K7EN88 272 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS6O14544 535 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B17O75795 530 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFAND5O76080 213 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-16P01601 117 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX2P28328 305 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF141Q15928 474 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NNATQ16517 81 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF220Q5VTB9 566 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PLAG1Q6DJT9 500 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KIRREL2Q6UWL6 708 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PACS2Q86VP3 889 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 VRK2Q86Y07 508 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC34A3Q8N130 599 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11G2Q8NGC1 345 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MESP1Q9BRJ9 268 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf16Q9BUW7 83 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 VCXQ9H320 206 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB9F8W1W9 429 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMDEC1O15204 470 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RHCEP18577 417 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT20P35900 424 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1E2P47887 323 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP12AP54707 1039 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NRG3P56975 720 aa28.66■■■□□ 2.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 NRF1Q16656 503 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM69BQ5VUD6 431 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 LPCAT4Q643R3 524 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CARM1Q86X55 608 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ELP5Q8TE02 316 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DIO2Q92813 273 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCL3Q9NQ33 180 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa28.65■■■□□ 2.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DTX1Q86Y01 620 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SVOPLQ8N434 492 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ICA1LQ8NDH6 482 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGDIGQ99819 225 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NTN4Q9HB63 628 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP25Q9NPA2 562 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DMXL1Q9Y485 3027 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF25A6NGN4 478 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ICAM2P13598 275 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF1BP20333 461 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTP40126 519 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX3P48380 749 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD16Q32M84 506 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAMD1BQ3KR37 738 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZAR1Q86SH2 424 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4Z1Q86W10 505 aa28.64■■■□□ 2.17
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