RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 G6PC3Q9BUM1 346 aa27.01■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 BLOC1S6Q9UL45 172 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 DTX4Q9Y2E6 619 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa27.01■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CLPSP04118 112 aa27■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RORAP35398 523 aa26.99■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC38A4Q969I6 547 aa26.99■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa26.99■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa26.97■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 A8MUA0 341 aa26.96■■□□□ 1.91
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