RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCST2Q5T1A1 773 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MARCH3Q86UD3 253 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PACS2Q86VP3 889 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZFP90Q8TF47 636 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF138Q8WVD3 245 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHF12Q96QT6 1004 aa15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASNA1O43681 348 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX4O95219 450 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT16P08779 473 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MASP1P48740 699 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPC1P48995 793 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBCELQ5QJ74 424 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA21Q7Z572 469 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSRB3Q8IXL7 192 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PP18 115 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMGN4O00479 90 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MVDP53602 400 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FUT5Q11128 374 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLF10Q13118 480 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 STX5Q13190 355 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNTA1Q13424 505 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ATCAYQ86WG3 371 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF597Q96LX8 424 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SDF2Q99470 211 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARMCX1Q9P291 453 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ESPL1Q14674 2120 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A096LPI6 279 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCMRO60667 390 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GATSQ8NAP1 163 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 VAPAQ9P0L0 249 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FREM3P0C091 2139 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 FBP2O00757 339 aa15.92■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX3O60493 162 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 WISP1O95388 367 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ETFAP13804 333 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GDF1P27539 372 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KHKP50053 298 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC10A1Q14973 349 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR7Q8TB68 274 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.92■□□□□ 0.14
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