RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540103.1

NPIPB4-212, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, humanhuman

TSL 5

Gene NPIPB4, Length 631 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4-212ENST00000540103 NDE1Q9NXR1 346 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 DOCK7Q96N67 2140 aa7.31□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 AKAP6Q13023 2319 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 C1orf226A1L170 272 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 AHRRA9YTQ3 701 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 B4DXG7 233 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SYT5O00445 386 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TO15178 435 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 KRT34O76011 436 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 UBOX5O94941 541 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ANP32DO95626 131 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 EPPINO95925 133 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ATP1B1P05026 303 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 HPNP05981 417 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 IL3P08700 152 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 COX4I1P13073 169 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GABRA1P14867 456 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NAGAP17050 411 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 DDCP20711 480 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ABCD3P28288 659 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NTSP30990 170 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 EMDP50402 254 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TBCELQ5QJ74 424 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 WLSQ5T9L3 541 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 VASNQ6EMK4 673 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TAGAPQ8N103 731 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NAXEQ8NCW5 288 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FAM13CQ8NE31 585 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TSPEARQ8WU66 669 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 RNF138Q8WVD3 245 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 MTERF3Q96E29 417 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SPDL1Q96EA4 605 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GNRHR2Q96P88 292 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 OR52E6Q96RD3 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NODALQ96S42 347 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 DOHHQ9BU89 302 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 LDAHQ9H6V9 325 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GID8Q9NWU2 228 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ABCA4P78363 2273 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 MED12LQ86YW9 2145 aa7.3□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 A0A1W2PP18 115 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 CAPN14A8MX76 684 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 MRASO14807 208 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 AIM2O14862 343 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PDPK1O15530 556 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PPM1BO75688 479 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 SNX4O95219 450 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 KCNH1O95259 989 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PGRP06401 933 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 KRT16P08779 473 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 CT45A8P0DMV1 189 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 CT45A9P0DMV2 189 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NT5EP21589 574 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 DRD5P21918 477 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PTPN6P29350 595 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 GPC1P35052 558 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TIMP3P35625 211 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 PPICP45877 212 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 TRPC1P48995 793 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NUDT2P50583 147 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 KCNJ2P63252 427 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 NFYCQ13952 458 aa7.29□□□□□ -1.24
NPIPB4-212ENST00000540103 RCAN2Q14206 197 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms