RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSIG8P0DPA2 414 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPMP14384 443 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGT1P19440 569 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASP2P42575 452 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPICP45877 212 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ1P48048 391 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKL1Q00532 357 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK16Q00536 496 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAT2Q10469 447 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP4K2Q12851 820 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFR3AQ14156 821 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDK4Q16654 411 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HBMQ6B0K9 141 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED27Q6P2C8 311 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP43Q70EL4 1123 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP43Q8NFH3 380 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7G3Q8NG95 312 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35A4Q96G79 324 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC6A7Q99884 636 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPKQ9BS16 269 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYNNQ9NPC7 610 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0A6YYD5 115 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN2O60636 221 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL33O95760 270 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBX7O95931 251 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HKR1P10072 659 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPORP19235 508 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTAFRP25105 342 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EVI2BP34910 448 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LTB4RQ15722 352 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSTF1Q92882 214 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HPS1Q92902 700 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTBPQ96DY7 904 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR34Q96EX3 536 aa8.95□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPAS1Q99742 590 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STOML1Q9UBI4 398 aa8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0J9YW62 118 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TO15178 435 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK16O75716 305 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD51DO75771 328 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT17P0C025 328 aa8.94□□□□□ -0.98
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