RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAMB2P55268 1798 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YEATS2Q9ULM3 1422 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MUU9 505 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C19orf81C9J6K1 198 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDLIM1O00151 329 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANGPTL7O43827 346 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HCN1O60741 890 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPOP01588 193 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR2F1P10589 423 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HEPACAMQ14CZ8 416 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDO1Q16878 200 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BMP2KLQ5H9B9 411 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SKA3Q8IX90 412 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OSR2Q8N2R0 312 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UCN3Q969E3 161 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASL11BQ9BPW5 248 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDFIP1Q9BT67 221 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VPS18Q9P253 973 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCDC2Q9UHG0 476 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EI24O14681 340 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHUKO15111 745 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMY1CP0DJD4 496 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPIAL4GP0DN37 164 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPBWR1P48145 328 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENPEPQ07075 957 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPAT3Q53EU6 434 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM205BPQ63HN1 556 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HCP5Q6MZN7 132 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM180BQ6P0A1 224 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDPD3Q7L5L3 318 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASL10BQ96S79 203 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FANCFQ9NPI8 374 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNPLA3Q9NST1 481 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVK-19Q9WJR5 959 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H0YIG0 161 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 K7N7A8 449 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCRG1O75711 98 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPNE6O95741 557 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHRNA1P02708 482 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR2MP0CAP2 368 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GLULP15104 373 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AQP1P29972 269 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NNMTP40261 264 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IER3P46695 156 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAPZA2P47755 286 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPS1P60891 318 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP51A1Q16850 503 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCA5Q86VQ0 697 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52I1Q8NGK6 324 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CKAP2Q8WWK9 683 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESR2Q92731 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COG3Q96JB2 828 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A23Q9BV35 468 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LHX3Q9UBR4 397 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNX8Q9Y5X2 465 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10H3O60404 316 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA0754O94854 1291 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CT45A8P0DMV1 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CT45A9P0DMV2 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPT2P23786 658 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADORA2BP29275 332 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIR2DS2P43631 304 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STARP49675 285 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CT45A2Q5DJT8 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERMARDQ5T6L9 678 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAXO2Q658L1 398 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMARCD3Q6STE5 483 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCP2Q8IVA1 136 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTURNQ8N3F0 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms