RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 SOX30O94993 753 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 ETFAP13804 333 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF597Q96LX8 424 aa12.28□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 OLAHQ9NV23 265 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 GID8Q9NWU2 228 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12.28□□□□□ -0.44
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PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT2P50583 147 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MTPNP58546 118 aa12.27□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
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