RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ASB4Q9Y574 426 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GVI7 797 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 KDM4BO94953 1096 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TGFB1P01137 390 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LIMS3P0CW19 117 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LIMS4P0CW20 117 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ACP2P11117 423 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TRAM1L1Q8N609 369 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TMEM129A0AVI4 362 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 H0YIV9 168 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SEMA7AO75326 666 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RECKO95980 971 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MT-ND4P03905 459 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ELFN1P0C7U0 828 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 XPAP23025 273 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BLVRAP53004 296 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RAB40BQ12829 278 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MAP4K2Q12851 820 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 C12orf40Q86WS4 652 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF740Q8NDX6 193 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR2T4Q8NH00 348 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF480Q8WV37 535 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B8Q92506 261 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SHARPINQ9H0F6 387 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR51B5Q9H339 312 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CPNE7Q9UBL6 633 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 IL36AQ9UHA7 158 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RASD1Q9Y272 281 aa12.65□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SERTM1A2A2V5 107 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RHOP08100 348 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ARAFP10398 606 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BTCP35070 178 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OPRD1P41143 372 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SELENOPP49908 381 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R50P59544 299 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TBPL1P62380 186 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RNLSQ5VYX0 342 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PODNL1Q6PEZ8 512 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SIAH3Q8IW03 269 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 STPG2Q8N412 459 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 BMPERQ8N8U9 685 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR5M3Q8NGP4 307 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 WDR48Q8TAF3 677 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FOPNLQ96NB1 174 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SEC14L3Q9UDX4 400 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 FBXW2Q9UKT8 454 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A23A1A5C7 686 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 L7N2F9 121 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PRODHO43272 600 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 PI15O43692 258 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ADH1AP07327 375 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MMP11P24347 488 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 MMP12P39900 470 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLC1A3P43003 542 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 B2MP61769 119 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 DUSP6Q16828 381 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TCTE1Q5JU00 501 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 WASH2PQ6VEQ5 465 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 SFTPA1Q8IWL2 248 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-212ENST00000488380 TOX2Q96NM4 488 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms