RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 SEC14L5O43304 696 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 EMC8O43402 210 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PCDH7O60245 1069 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PLOD3O60568 738 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFS7O75251 213 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4F21O95013 312 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 INHBAP08476 426 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SBK3P0C264 359 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CD8BP10966 210 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 COL6A2P12110 1019 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD3B1P14060 373 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 POU2F1P14859 743 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SRD5A1P18405 259 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 HSD3B2P26439 372 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 IDUAP35475 653 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD17B3P37058 310 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKN1AP38936 164 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 STX5Q13190 355 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PINK1Q9BXM7 581 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FUT8Q9BYC5 575 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF122Q9H9V4 155 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MED11Q9P086 117 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-39P01824 125 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRT6BP04259 564 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 THBS2P35442 1172 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNJ5P48544 419 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT6CP48668 564 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 HTR6P50406 440 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINB9P50453 376 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 CLCQ05315 142 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FGFBP1Q14512 234 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 RASA2Q15283 850 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 UNC50Q53HI1 259 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF611Q8N823 705 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 CAVIN3Q969G5 261 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 APIPQ96GX9 242 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF382Q96SR6 550 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PAFAH2Q99487 392 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 EBPLQ9BY08 206 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM160Q9NX00 188 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 SENP1Q9P0U3 644 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 PROCRQ9UNN8 238 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.44□□□□□ -1.06
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