RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 JADE3Q92613 823 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 VKORC1Q9BQB6 163 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 YIPF4Q9BSR8 244 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 RTN4RQ9BZR6 473 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 LDAHQ9H6V9 325 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EXO5Q9H790 373 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SERHLQ9NQF3 203 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GPR45Q9Y5Y3 372 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 BCKDKO14874 412 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CFLARO15519 480 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SCO2O43819 266 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FADS1O60427 444 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 TRAPPC6AO75865 159 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 KCNH1O95259 989 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 GP1BBP13224 206 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 IL12AP29459 219 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 TRPC1P48995 793 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 PRIM2P49643 509 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 NME5P56597 212 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 UFM1P61960 85 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 GRAMD1BQ3KR37 738 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 EIPR1Q53HC9 387 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CDC73Q6P1J9 531 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 RPTNQ6XPR3 784 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SPATA19Q7Z5L4 167 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ZAR1Q86SH2 424 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 GALNT10Q86SR1 603 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ANKRD46Q86W74 232 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ACTRT2Q8TDY3 377 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CDS1Q92903 461 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 MOAP1Q96BY2 351 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SARAFQ96BY9 339 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 MARK4Q96L34 752 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 OR52B2Q96RD2 323 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 STACQ99469 402 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SERHL2Q9H4I8 314 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FBXL2Q9UKC9 423 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 NOTCH2Q04721 2471 aa12.83□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 C9JVG2 144 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 KCNK2O95069 426 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ALOX5P09917 674 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SOAT1P35610 550 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 TOMM20Q15388 145 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CDSNQ15517 529 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 GXYLT1Q4G148 440 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 DCST1Q5T197 706 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CCNJQ5T5M9 372 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FIGNL1Q6PIW4 674 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 PLCZ1Q86YW0 608 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 EID3Q8N140 333 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CLEC4FQ8N1N0 589 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 COX18Q8N8Q8 333 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 OR5M9Q8NGP3 310 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FAM110BQ8TC76 370 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 DYDC1Q8WWB3 177 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ACTRT3Q9BYD9 372 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 OR2B2Q9GZK3 357 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 PIGUQ9H490 435 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 GIN1Q9NXP7 522 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SLC6A5Q9Y345 797 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FAM215AQ9Y5M1 114 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 FBN2P35556 2912 aa12.82□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 DIAPH2O60879 1101 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 UTS2O95399 124 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ACVR2AP27037 513 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 DGKQP52824 942 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 RPS26P62854 115 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 STX5Q13190 355 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 NHSL2Q5HYW2 709 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 NXNQ6DKJ4 435 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 RTL6Q6ICC9 239 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 OR5M10Q6IEU7 315 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 EPGNQ6UW88 154 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 APOOLQ6UXV4 268 aa12.81□□□□□ -0.36
SRRT-210ENST00000477529 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms