RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF708	P17019	499 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	RFX3	P48380	749 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PRKAG1	P54619	331 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CLDN18	P56856	261 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	MARCH3	Q86UD3	253 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CDH24	Q86UP0	819 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	NUP43	Q8NFH3	380 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	GPR151	Q8TDV0	419 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	GIMAP5	Q96F15	307 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CLCA1	A8K7I4	914 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM114	B3SHH9	223 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNH1	O95259	989 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	UTS2	O95399	124 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	IL18BP	O95998	194 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	OPRM1	P35372	400 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	KIR2DL3	P43628	341 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	DGKQ	P52824	942 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	STX5	Q13190	355 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	WNT2B	Q93097	391 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	LRRC46	Q96FV0	321 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	EMC8	O43402	210 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	RCBTB2	O95199	551 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ZWINT	O95229	277 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	MAPK1	P28482	360 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PEX19	P40855	299 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF844	Q08AG5	666 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	FOXF2	Q12947	444 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	MLC1	Q15049	377 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	BCL2A1	Q16548	175 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	KRT71	Q3SY84	523 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	APOOL	Q6UXV4	268 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC9A6	Q92581	669 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	TM9SF2	Q99805	663 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	JKAMP	Q9P055	326 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ACP2	P11117	423 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	LAMP1	P11279	417 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	HK1	P19367	917 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	HPCAL1	P37235	193 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	PRR5	P85299	388 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SZRD1	Q7Z422	152 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	FBXO30	Q8TB52	745 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM110B	Q8TC76	370 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	C1orf50	Q9BV19	199 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	DOCK7	Q96N67	2140 aa		18.89	■□□□□ 0.62
CTBP2-208	ENST00000476817	SPG11	Q96JI7	2443 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	ANGPTL1	O95841	491 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	PEPD	P12955	493 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	SERPINB4	P48594	390 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	PTGR1	Q14914	329 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	DUSP5	Q16690	384 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	IL23R	Q5VWK5	629 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	RAET1L	Q5VY80	246 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CTBP2-208	ENST00000476817	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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