RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	COX10	Q12887	443 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SP140	Q13342	867 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NFATC2	Q13469	925 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NDUFA9	Q16795	377 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	ST3GAL2	Q16842	350 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	GSG1	Q2KHT4	349 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MPPE1	Q53F39	396 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SYT14P1	Q58G82	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	HBM	Q6B0K9	141 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SHF	Q7M4L6	423 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	KRT74	Q7RTS7	529 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MIB1	Q86YT6	1006 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	GPR65	Q8IYL9	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NAGS	Q8N159	534 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FTMT	Q8N4E7	242 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NFKBID	Q8NI38	313 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MAL2	Q969L2	176 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	YIPF5	Q969M3	257 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TMEM203	Q969S6	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	RGMA	Q96B86	450 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SCRN2	Q96FV2	425 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	COQ10A	Q96MF6	247 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FRG2B	Q96QU4	278 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TCF25	Q9BQ70	676 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FUZ	Q9BT04	418 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	EBPL	Q9BY08	206 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	CIPC	Q9C0C6	399 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MAGEH1	Q9H213	219 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FANCF	Q9NPI8	374 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	HPF1	Q9NWY4	346 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032		A0A087X0M5	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032		A0A1B0GUH1	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032		A0A1B0GX30	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MTMR11	A4FU01	709 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	C2orf78	A6NCI8	922 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032		A6NCN8	305 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	POM121B	A6NF01	834 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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