RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472017.1

PRKCZ-213, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-213	ENST00000472017	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CLCA1	A8K7I4	914 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017		B4DXG7	233 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PEX11A	O75192	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	IL18BP	O95998	194 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	BPGM	P07738	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	BCKDHA	P12694	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	STX5	Q13190	355 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	NUP43	Q8NFH3	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	WNT2B	Q93097	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MED11	Q9P086	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	NTM	Q9P121	344 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	F8	P00451	2351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	EMC8	O43402	210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	TYROBP	O43914	113 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	NKX2-2	O95096	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RCBTB2	O95199	551 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	UTS2	O95399	124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PEPD	P12955	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ZNF708	P17019	499 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	HK1	P19367	917 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	HPCAL1	P37235	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MAP3K8	P41279	467 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CLDN18	P56856	261 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	FOXF2	Q12947	444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	KRT71	Q3SY84	523 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	XKR7	Q5GH72	579 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MREG	Q8N565	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	C3orf30	Q96M34	536 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	CTAG2	O75638	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ACP2	P11117	423 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ARRB2	P32121	409 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ETV4	P43268	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PRR5	P85299	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	MLC1	Q15049	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCZ-213	ENST00000472017	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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